酵素的催化反应可受许多因子(去了解)的影响而加速或减缓。许多的酵素在制造的细胞中并不活动，停留在酶原状态，在遇到致活因子的作用之后才具有活性，此一机制具有保护功能，可避免制造该酵素的细胞被酵素作用。此外，抑制剂可使酵素的活性降低或者完全失去活性。

有些物质因构形与酵素受质相似，可与酵素结合而抑制酵素的作用。例如青霉素因构形与细菌受质类似，可与细菌合成细胞壁的一种重要酵素发生不可逆的结合，导致细菌无法正常合成细胞壁而死亡。重金属离子，例如Hg2+、Pb2+、Cd2+及砷化物等，可取代原来酵素所需的金属，因而使酵素失去活性。

329c30d3酵素在不同细胞内的表现量并不完全相同，因为酵素的生合成需受到基因的调控（DNA→mRNA→protein），包括基因的开或关及基因表现的程度，都会影响该酵素在细胞内的量，进而影响该酵素所控制的代谢反应。酵素活性的调节，对细胞生理极为重要，细胞通常可视生理需要自由控制酵素活性的高低。

酵素主要由蛋白质所构成，不过许多酵素还需加上其他物质，才能进行催化反应，例如辅酶与辅助因子等。全酶是具有完整分子构造及催化能力的酵素。一般酵素由蛋白质构成，但某些酵素为糖蛋白或脂蛋白。有些还要加上辅助因子，才成为功能完全的酵素，称为全酶。若全酶失去了辅助因子，剩下的部分称为酶原。

有些酵素在催化反应中常需一些特殊的非蛋白质有机化合物或金属离子的协助，才具有活性化加强其活性。一些非蛋白质的小分子物质会加入酵素构造中，以帮助催化反应进行。这些辅助酵素作用的小分子物质，分子构造复杂且多样，通称为辅酶，在哺乳类中多由维生素代谢而来，无法自行合成，例如维生素B群、叶酸、烟碱酸等。

辅助因子包括金属离子如Zn2+、Mg2+、Mn2+、Fe2+、Cu2+等，以离子键结合在His、Cys、Glu等胺基酸；细胞多使用较轻的金属，重金属大多有害处。

促进剂为非必需因子，但若有其存在，则可加强酵素的活性。一般可分为两大类：一为非必需金属离子，例如Mg2+等；另一为硫氢化合物，例如Cys等。